Имеется собственный антизапрет сервер, можно ли на его основе сделать прокси с генерацией pac файла как это сделано в основном проекте? Думаю будет удобно использовать на разных ОС и устройствах без необходимости поднимать VPN соединение

Нет, готового средства для настройки прокси и PAC-файла не поставляется.

Вариант с VPN более надёжен и кроссплатформенен. Шифрование прокси работает только в Firefox/Chrome и браузерах, основанных на них, т.е. в Safari, Internet Explorer работает не будет, также не поддерживаются мобильные устройства.

Спасибо за ответ. Да, в целом так и есть. Но бывают случаи когда pac файл сильно выручает.
А не могли бы вы поделиться методом реализации/скриптами/кодом ?

Код тот же, что в контейнере: Bitbucket
Каких-либо особых настроек на стороне прокси-сервера не требуется, если не будете делать его публичным, кроме, разве что, Secure Web Proxy (HTTPS-прокси/TLS-прокси, поддерживается Squid, либо можно поставить перед любым HTTP прокси-сервером TLS-сервер, например nginx или stunnel).
Браузеры не поддерживают передачу логина/пароля в PAC-файле.

спасибо большое за наводку, посмотрю